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新疆各類濕地148.35萬ha（包括水稻田6.40萬ha），其中河流濕地45個20.57萬ha、湖泊濕地108個69.69萬ha、沼澤濕地148個36.93萬ha、庫塘濕地134個14.76萬ha。其中，自然濕地127.19萬ha，占國土面積的0.76%，中國濕地的平均比重高于新疆濕地比重的近4倍；加庫塘濕地14.76萬ha共141.95萬ha，占國土面積的0.85%；再加水稻田濕地6.40萬ha共148.35萬ha，占國土面積的0.89%。新疆濕地的垂直分布從－155m至山地4 800m，形成了復雜多樣的內(nèi)陸濕地生態(tài)系統(tǒng)，與沿海地區(qū)和中部地區(qū)相比，有一定的特色，主要是孤島性、多變性、富營養(yǎng)、礦化度高、原生濕地的特征減弱或消失等特點。
新疆濕地比重雖然遠低于中國的平均水準，但是，新疆在西北濕地比重較高，列入中國重點濕地也較多，到2007年，列為國家重點保護濕地名錄有22個。其中以沼澤的1個，以河流的5個，以湖泊的16個。
新疆濕地面積主要分布在巴音郭楞蒙古自治州、博爾塔拉蒙古自治州、阿勒泰地區(qū)，分別占新疆濕地面積的39.43%、13.64%、11.22%。3個地州占新疆濕地面積的61%以上。喀什地區(qū)、阿克蘇地區(qū)、和田地區(qū)、塔城地區(qū)占4.54%～2.17%；、哈密地區(qū)、伊犁哈薩克自治州直屬縣市、克孜勒蘇柯爾克孜自治州、克拉瑪依市、昌吉回族自治州、吐魯番地區(qū)占1.74%～0.48%。從濕地在各地區(qū)分布狀況可以看出，濕地主要分布于塔里木河流域、阿勒泰地區(qū)和博爾塔拉蒙古自治州。
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